Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Itga6Q61739 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Itga6Q61739 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms