Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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BcanQ61361 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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BcanQ61361 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BcanQ61361 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BcanQ61361 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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