Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ctnna2Q61301 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ctnna2Q61301 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms