Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Hcfc1Q61191 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hcfc1Q61191 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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