Protein–RNA interactions for Protein: Q61115

Ptch1, Protein patched homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch1Q61115 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ptch1Q61115 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ptch1Q61115 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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