Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxd3Q61060 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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