Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klf3Q60980 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klf3Q60980 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms