Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rbbp4Q60972 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms