Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Meis1Q60954 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Meis1Q60954 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms