Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Klf4Q60793 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Klf4Q60793 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms