Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Csnk2a1Q60737 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms