Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Samhd1Q60710 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Samhd1Q60710 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms