Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Foxd4Q60688 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 4931428L18Rik-202ENSMUST00000135245 889 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Foxd4Q60688 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms