Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprnQ60673 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprnQ60673 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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PtprnQ60673 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PtprnQ60673 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms