Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CttnQ60598 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CttnQ60598 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms