Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc5a6Q5U4D8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc5a6Q5U4D8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms