Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scaf1Q5U4C3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scaf1Q5U4C3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms