Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rnf145Q5SWK7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rnf145Q5SWK7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms