Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ccdc42Q5SV66 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc42Q5SV66 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms