Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bbs12Q5SUD9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Bbs12Q5SUD9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms