Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Psme4Q5SSW2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psme4Q5SSW2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms