Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TefmQ5SSK3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TefmQ5SSK3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms