Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg7Q5RJH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Smg7Q5RJH6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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