Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trav6-2Q5R1I4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trav6-2Q5R1I4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms