Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Trappc1Q5NCF2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trappc1Q5NCF2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc1Q5NCF2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trappc1Q5NCF2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Trappc1Q5NCF2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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