Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim58Q5NCC9 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim58Q5NCC9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms