Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps41Q5KU39 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms