Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZH7

Slc38a8, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 8, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a8Q5HZH7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc38a8Q5HZH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc38a8Q5HZH7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slc38a8Q5HZH7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc38a8Q5HZH7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc38a8Q5HZH7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Slc38a8Q5HZH7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms