Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SynaQ5G5D5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SynaQ5G5D5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms