Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fam208bQ5DTT3 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
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