Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syce1lQ5D525 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syce1lQ5D525 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms