Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Urb1Q571H0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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