Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx33Q4VAA7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx33Q4VAA7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snx33Q4VAA7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Snx33Q4VAA7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Snx33Q4VAA7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx33Q4VAA7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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