Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Slc27a5Q4LDG0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc27a5Q4LDG0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Slc27a5Q4LDG0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Slc27a5Q4LDG0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a5Q4LDG0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms