Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL18

Tmem171, Transmembrane protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem171Q4KL18 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem171Q4KL18 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem171Q4KL18 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms