Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL05

Gm10488, Predicted gene 10488, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10488Q4KL05 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm10488Q4KL05 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm10488Q4KL05 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms