Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc110Q3V125 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ccdc110Q3V125 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms