Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc160Q3UYG1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc160Q3UYG1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms