Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX62

Ccdc114, Coiled-coil domain-containing protein 114, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc114Q3UX62 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc114Q3UX62 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc114Q3UX62 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc114Q3UX62 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc114Q3UX62 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc114Q3UX62 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms