Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTW2

A530084C06Rik, RIKEN cDNA A530084C06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A530084C06RikQ3UTW2 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Sval2-203ENSMUST00000120605 497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Cgrrf1-203ENSMUST00000133989 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm10058-201ENSMUST00000079797 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8988-201ENSMUST00000155015 1240 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A530084C06RikQ3UTW2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms