Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q3UST5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3UST5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3UST5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3UST5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Q3UST5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q3UST5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q3UST5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q3UST5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q3UST5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q3UST5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms