Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm6899Q3USS0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Gm6899Q3USS0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm6899Q3USS0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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