Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hdgfl2Q3UMU9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms