Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ankrd27Q3UMR0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ankrd27Q3UMR0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms