Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrch2Q3UMG5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrch2Q3UMG5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms