Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ceacam12Q3UKP4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ceacam12Q3UKP4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms