Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

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Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx27Q3UHD6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx27Q3UHD6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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