Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccdc177Q3UHB8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc177Q3UHB8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms