Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5113Q3UGK8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm5113Q3UGK8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms