Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rrp36Q3UFY0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rrp36Q3UFY0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms